ويتم بانواع كثيرة منها: 

1. الاغتيال المباشر، وهو عبارة عن مجموعة من عملاء الموساد والتي تقوم بعملية الاغتيال ومن ثم الهروب إلى إسرائيل وهذه المجموعة يطلق عليها اسم، فرفة التصفية ..

2. الاغتيال بواسطة العملاء، وهذا بالرغم من اتساع نشاط الموساد في أماكن كثيرة من العالم إلا أنها أحيانا لا تستطيع أن تصل إلى الهدف، وذلك اللحرص الأمني الشديد الذي يتخذه الهدف في تضليل العملاء، وجهاز الموساد ولكن تم التمكن من اغتيال البعض بواسطة العملاء أنفسهم مباشرة وتسمى هذه الفرق بالوحدات الخاصة،.

حيث ينغفي العملاء المحليون ومجموعة من المخابرات الصهيونية بزي فلسطيني ويستقلون سيارات مدنية ويقتربون من المناضل ويطلقون 

النار عليه 

2. الاغتيال بواسطة الرسائل المفخخة: وتتم هذه الاغتيالات بواسطة الرسائل والطرود المفخخة وهي طريقة قديمة تستخدمها الموساد في اغتيال القادة الفلسطينيين والعرب في الماضي لكن هذا النوع من الاغتيالات لم يستمر لأنه لم يحقق أهدافه لأن التطور العلمي والتكنولوجي أصبح بحدد طبيعة ما تحتويه هذه المظاريف.

الاغتيال بواسطة التفجير عن بعد: وهو أسلوب قديم في مجال العمليات العسكرية، حيث كانت تقوم مجموعة بزرع الألغام والعبوات الناسفة 

في الشوارع، ويتم استخدام تلك الطريقة مع النشطاء الفلسطينيين مثال اغتيال الشهيد القسامي يحيى عياش والشهيد إياد الحردان الذي كان يتردد على تليفون عمومي بالشارع وقام العملاء برصد تحركات الشهيد وتردده على التليفون، فقاموا بزرع عبوة ناسفة في التليفون العمومي وعند وصول الشهيد واستخدامه لهذا الهاتف قام الموساد بتفجير التليفون مما أدى لاستشهاده على الفور. 

و. الاغتيال بواسطة الطائرات، وهو أكبر الأعمال الإرهابية التي عرفها التاريخ بشاعة ويتم الأغنيال بقصف البيوت والسيارات وهذه العملية تحتاج العملاء على الأرض، كما حدث مع الشهيد الشيخ أحمد ياسين وغيره.

6 - الاغتيال بواسطة الحقن المسامة: وهي من أشد أنواع الاغتيالات إرهاب وتعتمد على الوصول إلى الضحية ثم حقنها فتموت على الفور،

7. الإعدام الخفي: وهذا النوع يتم بشكل خفي لا يعرف العالم تفاصيل هذا التوع. حيث يتم بالخفاء وبين القضبان، حيث يتم اغتيال المناضلين في المستشفيات الصهيونية وبشكل بطيء، أو داخل زنازين الاحتلال ومكاتب المخابرات.

ومن أمثال هذا النوع: الإسقاط من علو شاهق مثال ذلك إسقاط الشهيد قاسم أحمد الجعبري من طائرة مروحية في عام 1997 م بعد اعتقاله والتحقيق معه 

والاغتبال داخل الزنازين والاغتيال بالتعذيب والممارسات الوحشية والاغتيال أثناء الإضراب عن الطعام وهذا بالنسبة للأسرى عندما يقومون بالإضراب للمطالبة بأبسط حقوقهم فينتهز الأحتلال هذه الفرصة ويقوم بعملية الاغتيال 

الاغتيال بالإهمال الطبي والمعالجة السريعة، حيث يتم الاغتيال بالإهمال وعدم تقديم العلاج لهم، وهذه الطريقة يتم استخدامها في قتل الأسرى لدى سلطات الاحتلال الإسرائيلى وعند النظم الفاشية والديكتاتورية في دول العالم المتخلف سياسيا.